Den tidligere skikongen hadde ingen muligheter til å henge med de beste og var i mål slått med fire minutter og 44 sekunder av teten.
Svenske Nils Dahlsten var best på de 44 kilometerne fra Nordli i Lierne kommune i Trøndelag til Gäddede i Strömsund kommune i Sverige.
Svensk ble det også på plass to og tre i form av Marcus Johansson og Johannes Eklöf. Northug krysset målstreken til niendeplass.
Norsk-irske Thomas Maloney Westgård ble nummer fire, mens Torleif Syrstad endte på femteplass.